Las baterias del ardrone son LIPOS http://es.wikipedia.org/wiki/Bater%C3%ADa_de_pol%C3%ADmero_de_litio
En el caso de estas baterias que son 3S quiere decir que tienen tres celdas de 3.7V, que sumados hacen los 11.1V
Estas celdas tienen que tener siempre los mismos voltajes, ya que si no al decargarlas puede que alguna celda baje de los 3v.
Una celda de una lipo que baje de los 3v se rompe definitivamente, y puede hasta arder en algunos casos.
Hay mucha info escrito sobre esto en este foro y fuera de el, por lo que te aconsejo por tu bien que te informes bien, estas baterias si no se utilizan bien son peligrosas.